1989年1月7日，迟锡增任化学系主任，冯文林任化学系副系主任，曹敬东任化学系系主任助理，6月，孙兆祥任澳门永利唯一官网304技术研究院院长。

1月，应用化学研究所BNP-III型感光剂通过技术鉴定，这是一种能与国际上先进产品相提并论的高粘度阳图PS版感光剂。4月8日，化学系受四川万县地区委托研制的“菜籽油制备芥酸工业品”通过技术鉴定。9月12日，应用化学研究所承担的国家“七五”重点技术改造项目“BFR-1型液体感光树脂”通过了由化工部、国家新闻出版署的技术鉴定。11月16日，由化学系有机教研室陈庆华、李佩文、李和、舒瑞琪、黄彬、耿哲6人研制的“由菜籽油油脚制取十三碳破二酸”的技术鉴定会召开。12月18日，学校批复生产设备处，同意应用化学研究所化工实验厂更换营业执照，并更改法人代表。刘若庄主持的“中间体、过渡态和反应途径势能面理论研究”获1989年国家教委科技进步二等奖。由余尚先主持的“BNP系列阳图PS版感光性树脂（BNP-I，BNP-II，BNP-III）” 获国家教委科技进步二等奖。

9月，化学系获多项教学优秀成果奖。吴国庆等主持的“化学系本科教学改革”获北京市教学优秀成果奖。刘若庄的“注重教学方法，培养高质量研究生”、王佩珍等的“有机化学（有机I、II）教学”、王定锦等的“”、化学工程基础实验及课堂演示实验的研究与开发”、姚乃荭等的“化学教学法实验课改革”、徐伟英等的“推行标准化考试，深入进行教学改革”项目获校级优秀教学成果奖。

10月，应化学系放辐化研究室陈文琇教授邀请，英国东北威尔士大学专家纳娃博士来校访问，先后就辐射化学及光学内容作三次学术报告，副校长顾明远会见来宾。

本年度，化学系党总支书记孙兆祥获评为北京市优秀党务工作者。